Деревянная Андреевская церковь была построена в 1646 году казаками. К 1740-м годам церковь обветшала и на её месте в 1744 году на деньги купца Авраама Сумкина поставили небольшой каменную церковь святого Андрея. Через десять лет храм был надстроен, а в 1759 году достроена трапезная, придел и сооружена колокольня, которая в 1806 году из-за трещин была разобрана и заменена меньшей. После этого храм приобрёл окончательный вид. При храме действовала церковно-приходская школа. В 1818 году возвели каменную ограду. После революции 1917 года община храма была ликвидирована.

Весной 2001 года местная общественная организация клуб «Добрая воля» обратился к архиепископу Димитрию с инициативой возрождения храма. Инициатива была поддержана, и ответственным от епархии за возрождение храма был назначен преподаватель Тобольской духовной семинарии, священник храма Семи Отроков Ефесских иерей Вадим Базылев. Была оборудована молитвенная комната в притворе под колокольней.
В 2008 году была завершена внешняя отделка колокольни, на куполе храма и колокольни установлены кресты.

13 декабря 2013 года восстановленный храм был освящен митрополитом Тобольским Димитрием (Капалиным).
Богослужение в храме совершали: благочинный Тобольского округа,клирик храма Семи отроков Ефесских протоиерей Вадим Базылев; священник храма Семи отроков о. Иоанн Казанцев и священник храма Михаила Архангела о. Валерий Сирант.

28 сентября 2015 г. настоятелем храма назначен прот. Михаил Денисов.