Первые сады в Тобольске и его окрестностях появились в начале XIX века. Это сад Ермака, Аптекарский сад и Александровский сад. История ряда городских садов связана с посещением Тобольска царскими особами дома Романовых. Александровский сад – в 1837 г. Тобольск посетил цесаревич Александр Николаевич. После его гибели в 1881 г. тоболяки приняли решение установить часовню и разбили вокруг нее сад. И часовню, и сад назвали Александровским. Сад Ермака, основанный 23 августа 1839 года, в 1891 г. посетил Николай Александрович – будущий последний российский император Николай II. Аптекарский сад – первые упоминания о нем, по архивным данным, прослеживаются с 17.02.1810 года. В этот день купец Малков приобрел сад у генерала князя Мещерского.
В настоящее время в соответствии с генеральным планом развития Тобольска на территории городского округа расположено 27 парков и скверов и три памятника природы областного значения: «Окрестности дома отдыха «Тобольский», «Киселевская гора с Чувашским мысом» и «Панин бугор». Все они включают типичные для подзоны южной тайги биоценозы, а в составе флоры встречаются редкие и исчезающие виды растений Тюменской области